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<!DOCTYPE html>

<title>UniProt</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">UniProt</span></h1>

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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p>Die <b>Universal Protein Database</b>, kurz <b>UniProt</b>, ist die größte <a href="Bioinformatik" title="Bioinformatik">bioinformatische</a> <a href="Biochemie-Datenbank" title="Biochemie-Datenbank">Datenbank</a> für <a href="Protein" title="Protein">Proteine</a> aller Lebewesen und <a href="Viren" title="Viren">Viren</a>, und enthält Informationen über die Proteinfunktion und -<a href="Proteinstruktur" title="Proteinstruktur">struktur</a> sowie Links zu anderen themenrelevanten Datenbanken.<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Sie kombiniert die Daten von Swiss-Prot, TrEMBL und <a href="Protein_Information_Resource" title="Protein Information Resource">Protein Information Resource</a> (PIR) und wird in einem regelmäßigen Rhythmus herausgegeben.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Zusammensetzung">Zusammensetzung</h2></div>

<p>UniProt ist ein <a href="Konsortium" title="Konsortium">Konsortium</a>, das sich 2002 aus folgenden Komponenten zusammengeschlossen hat:

</p>

<ul><li>dem <a href="European_Bioinformatics_Institute" title="European Bioinformatics Institute">European Bioinformatics Institute</a> (EBI)</li>

<li>dem <a href="Swiss_Institute_of_Bioinformatics" title="Swiss Institute of Bioinformatics">Swiss Institute of Bioinformatics</a> (SIB)</li>

<li>der <a href="Protein_Information_Resource" title="Protein Information Resource">Protein Information Resource</a> (PIR)</li></ul>

<p>Das EBI verfügt über eine große Quelle bioinformatischer Daten, das SIB beherbergt die Server des (<a href="ExPASy" class="mw-redirect" title="ExPASy">ExPASy</a>) (<b>Ex</b>pert <b>P</b>rotein <b>A</b>nalysis <b>Sy</b>stem), welche essentielle Informationen für die <a href="Proteomik" title="Proteomik">Proteomik</a> bereitstellen. PIR, die von der National Biomedical Research Foundation (NBRF) betrieben wird, leitet sich von der ältesten Proteinsequenzdatenbank (<a href="Margaret_Oakley_Dayhoff" title="Margaret Oakley Dayhoff">Margaret Oakley Dayhoffs</a> <i>Atlas of Protein sequence and structure</i>) ab.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Die_UniProt-Datenbanken">Die UniProt-Datenbanken</h2></div>

<p>Jedes Mitglied des UniProt-Konsortiums pflegt die Datenbanken. Bis 2002<sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> produzierten EBI und SIB zusammen Swiss-Prot und TrEMBL. Das PIR stellte die Datenbank PIR-PSD (Protein Sequence Database) zur Verfügung.

</p><p>Swiss-Prot ist wohl die bekannteste Proteindatenbank auf Grund ihrer ausführlichen Querverweise, Literaturzitate, der Integration anderer Datenbanken und ihrer minimalen Redundanz. TrEMBL (Translated EMBL Nucleotide Sequence Data Library) ist eine Computer-annotierte Ergänzung der Swiss-Prot-Datenbank, die alle Übersetzungen von EMBL-Nukleotid-Einträgen enthält, die noch nicht in Swiss-Prot integriert vorliegen. Dies ermöglicht eine schnelle Datenbereitstellung.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Organisation">Organisation</h2></div>

<p>UniProt beinhaltet drei Elemente, die auf einen bestimmten Gebrauch spezialisiert sind:

</p>

<ul><li>Die UniProt Knowledgebase (<i>UniProtKB</i>) ist die zentrale Datenbank für Proteinsequenzen. Sie gibt Informationen über die Funktion und Klassifikationen der Proteine und stellt Querverweise her.</li>

<li>Das UniProt Archive (<i>UniParc</i>) speichert die Gesamtheit aller öffentlich erhältlichen Proteinsequenzdaten.</li>

<li>Die UniProt Reference Clusters (<i>UniRef</i>) sind Datenbanken, die dem Benutzer eine schnellere Suche ermöglichen, indem sie verhindern, dass redundante Verknüpfungen verfügbarer Sequenzen erscheinen. So werden unter anderem identische Sequenzen und Vor-Fragmente (von verschiedenen Organismen) in einer Dateneintragung kombiniert.</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.uniprot.org/">UniProt-Homepage</a></li>

<li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.uniprot.org/help/">UniProt-Hilfeseite</a></li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">The UniProt Consortium (2007):<i> The Universal Protein Resource (UniProt).</i> In: <i><a href="Nucleic_Acids_Res." class="mw-redirect" title="Nucleic Acids Res.">Nucleic Acids Res.</a></i> Bd. 35, S. D193-D197. <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17142230?dopt=Abstract">PMID 17142230</a>, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1093/nar%2Fgkl929">10.1093/nar/gkl929</a></span>.</span>

</li>

<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text"><span class="cite"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.uniprot.org/help/about"><i>UniProt.</i></a><span class="Abrufdatum"> Abgerufen am 17. September 2024</span>.</span><span style="display: none;" class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Adc&rfr_id=info%3Asid%2Fde.wikipedia.org%3AUniProt&rft.title=UniProt&rft.description=UniProt&rft.identifier=https%3A%2F%2Fwww.uniprot.org%2Fhelp%2Fabout"> </span></span>

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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